툴젠이 2022년 12월 29일 네이처 커뮤니케이션(Nature Communications)지에 ‘TAPE-seq (TAgmentation of Prime Editor sequencing)’ 관련 연구 성과를 게재하고, 세계에서 처음으로 Prime editor 유전자 가위의 Genome-wide off-target을 예측할 수 있는 방법을 개발했다고 밝혔다.

유전자 가위 치료제는 표적 서열(on-target) 이외에 비표적 서열(off-target)에도 교정이 될 수 있는 부작용이 존재한다. 따라서 유전자 가위 치료제를 개발해 각국 규제 기관의 허가를 받기 위해서는 유전체 내의 비표적 서열(Genome-wide off-target)들의 교정 정도를 측정해 제출해야 한다.

현재 Cas9 유전자 가위의 Genome-wide off-target을 예측하기 위한 방법은 GUIDE-seq (세포 실험), Digneome-seq(시험관 실험), Cas-OFFinder (컴퓨터를 이용한 예측) 등이 사용되고 있다. Cas9 유전자 가위에 Reverse transcriptase를 연결한 ‘Prime editor’의 경우 genome-wide off-target을 예측하는 방법이 아직 개발되지 않은 상황이었고, 툴젠이 세계에서 처음으로 이를 예측할 수 있는 실험 방법을 개발했다.

툴젠 플랫폼 연구소 이정준 소장은 “Genome-wide off-target 예측 기술은 유전자 가위 고도화 기술과 함께 유전자 가위 플랫폼 기술에서 가장 경쟁이 치열한 분야”이라며 “특히 Prime editor를 직접 사용한 off-target 예측은 여러 연구실에서 시도됐으나 툴젠이 이를 예측할 수 있는 방법을 세계 최초로 개발했다”고 말했다.

툴젠 김영호 대표이사는 “2021년 12월 코스닥 상장 이후 치료제 및 종자 사업 관련 파이프라인이 보다 강화되고 있으며, 플랫폼 테크놀로지의 확장을 위해 심혈을 기울이고 있다”며 “이번 TAPE-seq 기술 개발로 off-target 예측 플랫폼 기술의 새로운 장을 열어가게 됐고, 앞으로 Prime editor를 이용한 유전자 교정 치료제의 안전성 평가 분야에서 확대 적용이 가능할 것으로 판단한다”고 밝혔다.